脫硫廢水不外排時，因其含總砷、總鉛、總汞、總鎘等重金屬，屬《污水綜合排放標準》(GB8978-1996)中規定的有毒污染物(也稱第一類污染物)，不分行業和污水排放方式，一律在車間或車間處理設施廢水排放口采樣監測，監測頻次為每季度監測一次(注：外排時按每月監測一次執行)，并執行統一的濃度限值《火電廠石灰石-石膏濕法脫硫廢水水質控制指標》。

脫硫廢水進入脫硫廢水處理裝置，通過中和、除重金屬、絮凝、沉淀等反應處理到水質滿足高精度COD多參數分析測定儀DL/T 997-2006。脫硫廢水處理系統的沉降箱 pH 值、出水箱
pH 值、濁度、COD 控制范圍等應當符合操作規范，pH 計、濁度儀要定期校驗和比對，并保存手濁度儀工監測比對記錄。