肯定有影響了。
1、如果比色皿不干凈，這個肯定是影響測量數據的，不多說；
2、如果測樣的時候使用兩個比色皿，最好在測試之前將兩個比色皿校正一下，也就是清零，這樣可以消除因比色皿不一致帶來的誤差，如果不經過事先校正，可能會將比色皿之間的誤差帶入結果。這個對測微量或者痕量光度計物質時影響較大。
處理：
1、如果用兩個比色皿。將兩個比色皿都裝上清水，以其中一個為基準，將另外一個比色皿（同樣也是裝清水的）作為待測樣，記錄其讀數（或者用自動清零），把這一點作為你數據作圖的第一點；然后用該比色皿裝上樣品進行正常監測。
2、其實我個人推薦使用一個比色皿。用一個比色皿可以避免使用多個比色皿帶來的儀器誤差。方法很簡單，先將基準樣放進去，清零；再用同一個比色皿裝試樣，進行常規檢測，得出數據。這種操作在測痕量物質時比磁力攪拌器較管用，更別說普通的檢測了。

個人建議，僅供參考！