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脈沖場凝膠電泳技術與常規的直流單向電場凝膠電泳不同，這項技術采用定時改變電場方向的交變電源，每次電流方向改變后持續1秒到5分鐘左右，然后再改變電流方向，反復循環，所以稱之為脈沖式交變電泳。
脈沖電泳分離大分子DNA的介質是瓊脂糖，20kb—5000kb的線性雙鏈DNA片段在瓊脂糖凝膠的網孔中的泳動，就象蛇行式地尋找彎曲蜿蜓的孔隙。普通的單方向恒定電場給DNA分子的泳動動力其方向確定且不發生變化，所以嚴重影響凝膠電泳分離大分子量DNA 片段的效果。
脈沖電泳施加在凝膠上至少有兩個電場方向，時間與電流大小也交替改變，使得DNA分子能夠不斷地調整泳動方向，以適應凝膠中不規則的孔隙變化，達到分離大分子線性DNA的目的，最大分辨率為5000kb大小的線性DNA分子。
脈沖電泳儀主要用于20kb—5000kb的大分子量DNA的研究，主要應用于以下幾個方面：
l 基因組DNA的研究
l 細胞染色體核型的分析和研究
l 基因文庫的構建
WD-2101A 脈沖場凝膠電泳系統簡介
本脈沖電泳系統由4部分組成：
a.制冷器；b.脈沖電泳儀電源; c.制膠器及附件；d.脈沖電泳儀
WD-2101A 脈沖場凝膠電泳主要指標
1、凝膠板尺寸（L×W）：140mm×125mm；120mm×165mm兩種規格；
2、試樣格(齒數×齒寬×厚度)：14×6mm×1mm，14×6mm×2mm ；14×8.5mm×1mm，14×8.5×2mm；18×6mm×1mm，18×6mm×2mm
3、外型尺寸：（L×W×H）43cm×41cm×2cm；
4、緩沖液總容積2000ml；
5、正常工作條件為：環境溫度0℃～40℃；相對濕度≤80%；周圍無強烈振動；實驗臺應平整。
WD-2101A 脈沖場凝膠電泳使用條件
l 工作電源：交流220V 50Hz±10%
l 環境溫度：10-30℃
l 環境濕度：＜80%
l 輸入功率：
1.脈沖電泳儀電源：350VA
2.制冷器： 400W
連續工作時間：72h